A coloração azul alciano é utilizada para corar muco ácido e muco acético.

Quantidades excessivas de muco ácido não sulfatado são observadas no mesotelioma. Estes mucos estão presentes em quantidades normais nas paredes dos vasos sanguíneos, mas aumentam as lesões iniciais de aterosclerose.

O pH da solução de coloração azul de Alcian é muito importante e tem um efeito directo sobre a categoria de mucinas revelada por este método. O pH da solução de coloração azul de Alcian pode situar-se entre 0,4 e 2,5.

If the pH of the solution is 1.0, the solution will stain the sulfated acid mucins. These mucins are mainly found in the cartilage, the goblet cells of the large intestine and the bronchial serous

If the Alcian blue staining solution has a pH of 2.5, it is the carboxylated mucins in the connective tissues and the cartilage that will be stained.