As células-tronco embrionárias de rato (rESCs) são um modelo animal amplamente utilizado na pesquisa de células-tronco e biologia do desenvolvimento. As rESCs são geralmente isoladas de blastocistos derivados da massa celular interna de embriões de 3,5 dias e têm o potencial de gerar todos os tipos celulares presentes no corpo. Elas podem ser cultivadas em meios livres de soro, sem uma camada alimentadora, na presença de fator inibidor de leucemia (LIF) e proteína morfogenética óssea (BMP)-4, tornando-se um excelente modelo.

As rESCs são uma ótima ferramenta para entender muitos aspectos da biologia celular e do desenvolvimento, como regulação do ciclo celular, interações celulares durante o desenvolvimento e controle da expressão gênica. As rESCs são um sistema importante para entender a biologia de células-tronco e tecidos e para criar ratos transgênicos ou knockout, que são usados como modelos de doenças in vivo, por meio da recombinação homóloga. Aplicações recentes de rESCs incluem a identificação de fatores que mantêm a pluripotência, pesquisa sobre doenças genéticas humanas, identificação de novos fatores de diferenciação e biologia do câncer.