Diagnóstico del sarcoma en una sola reacción

 Diagnóstico del sarcoma en una sola reacción

La prueba SarcomaFusion detecta transcritos de fusión en sarcomas. Estos transcritos, asociados a subtipos específicos y tratamientos dirigidos, son cruciales para el cuidado de los pacientes. Mediante una tecnología patentada de PCR dependiente de ligadura, la prueba simplifica el diagnóstico y mejora nuestra comprensión de la biología del sarcoma. Su protocolo rápido y su robustez la convierten en una valiosa herramienta en oncología.

 

 

 Prueba de fusión del sarcoma

Una prueba única, basada en una tecnología patentada de PCR dependiente de ligadura

 

Los transcritos de fusión se observan con frecuencia en alrededor de 1/3 de los tumores de tejidos blandos, y la literatura científica describe más de 140 fusiones diferentes.

Estas fusiones se asocian a menudo con subtipos histológicos específicos y terapias dirigidas, lo que las convierte en marcadores moleculares de diagnóstico extremadamente útiles.

La detección precisa de estos transcritos de fusión es de vital importancia para el tratamiento óptimo de los pacientes con sarcomas.

En este contexto, la prueba SarcomaFusion, desarrollada por Genexpath, ofrece una solución rentable y eficaz para detectar los transcritos de fusión responsables de estos sarcomas. Gracias a este enfoque, los transcritos de fusión específicos de los sarcomas pueden detectarse y evaluarse en un único análisis completo, lo que simplifica el proceso de diagnóstico y permite comprender mejor la naturaleza molecular de los tumores sarcomatosos.

 

 

 


 
 

Utilización de la prueba

 
La prueba GENEXPATH SarcomaFusion se basa en un método de RT-PCR dependiente de ligadura (LD-RTPCR). Esta técnica semicuantitativa puede utilizarse para evaluar simultáneamente los niveles de expresión de un gran número de marcadores genéticos y, más concretamente para esta prueba, de translocaciones cromosómicas utilizando pares de sondas de oligonucleótidos específicas para cada uno de estos marcadores.
 

A quick and simple protocol 

  • A partir de un extracto de ARN total, bastan cuatro pasos para obtener las bibliotecas.
  • Una etapa de transcripción inversa.
  • Una etapa de hibridación con sonda de oligonucleótidos.
  • Una etapa de ligación.
  • Una etapa de amplificación por PCR, seguida de la secuenciación de las bibliotecas.
  • No se requiere purificación previa, lo que limita la pérdida de material y garantiza una alta sensibilidad.
  • Sondas dirigidas a secuencias genéticas cortas (40-60 bases), que ofrecen robustez frente a la degradación del ARN.
  • Adecuado para muestras difíciles, como biopsias de tejido incluidas en parafina.
  • Sólo se necesitan unas 105 secuencias por muestra para obtener un perfil de expresión analizable.
  • Las bibliotecas GENEXPATH SarcomaFusion pueden cargarse con otras bibliotecas de secuenciación para optimizar los costes.

 

 

 

Análisis informático preciso mediante software específico

Una vez finalizada la secuenciación, el archivo FASTQ puede cargarse en la plataforma RT-MIS. En sólo unos minutos de análisis, RT-MIS genera un archivo con los transcritos de fusión detectados. RT-MIS también proporciona una bibliografía asociada a los transcritos detectados, ofreciendo a los investigadores del cáncer una solución completa.
 

 

Duración de la manipulación 5hrs30’
Tiempo de trabajo real     1hr-1hr30’
Tipo de ácido nucleico RNA
Cantidad de entrada Entre 50 y 500ng de ARN en un volumen de 2μl.
Tipo de cáncer Sarcoma
Contenido del kit de reactivos Sondas dirigidas a más de 140 transcritos de fusión, códigos de barras, cebadores de secuencias
Método RT-PCR dependiente de ligadura
Descripción Detecta más de 140 transcritos de fusión asociados a sarcoma en 1 solo análisis.
Compatibilidad de los equipos MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina®
Tipo de muestras Biopsias de tejido fijadas e incluidas en parafina
Tecnología     Secuenciación de nueva generación

 

RT-MIS es, por tanto, sencillo, rápido y seguro para el usuario.

 

Ahora puede adquirir el kit que mejor se adapte a sus necesidades y obtener los mejores resultados en poco tiempo. 

 

Productos  Talla Gato#
SarcomaFusion

  Prueba 
8 reacciones

GEP-SF8

 16 reacciones

GEP-SF16 

 24 reacciones

GEP-SF24 

48 reacciones

GEP-SF48

 

 

Para más información :

 

 Consulte la publicación  de referencia del  kit SarcomaFusion